Epidemiological profile and follow-up of patients with pulmonary disease by non-tuberculous mycobacteria in Baixada Santista area, São Paulo

ABSTRACT Objective To present the frequency and species diversity of non-tuberculous mycobacteria, estimate the prevalence of non-tuberculous mycobacterial pulmonary disease, describe the epidemiological profile, and determine the follow-up of patients with non-tuberculous mycobacterial pulmonary disease living in a region with a high burden of tuberculosis. Methods This a retrospective cohort observational study using data records obtained from the Instituto Adolfo Lutz - Santos and from the São Paulo Sistema de Vigilância de Tuberculose do Estado de São Paulo in the period between 2000 and 2009. The studied variables were: socio-demographic characteristics, current and past history of tuberculosis, aspects related to diagnosis, and treatment and associated diseases. Results We included 319 non-tuberculous mycobacteria isolates in the study, corresponding to 257 patients. The species Mycobacterium kansasii (28.5%) and Mycobacterium fortuitum (16.6%) presented the higher occurrence. In 10.9% (24) of the patients, there was a criterion for confirming a case of pulmonary disease due to non-tuberculous mycobacteria. In relation to gender and age, male and individuals over 50 years old were the most frequent. Considering the confirmed cases, 47.8% had a past history of tuberculosis. Conclusion The lack of information about the cases is evident, since pulmonary disease due to non-tuberculous mycobacteria is not mandatory. The therapeutic regimen according to the identified species is fundamental for success in combating the infections caused by non-tuberculous mycobacteria. Besides that, information about the regional epidemiology of pulmonary disease caused by non-tuberculous mycobacteria and the search for associations with other comorbidities are important to establish the correct treatment. In order to improve surveillance of pulmonary diseases by non-tuberculous mycobacteria, we suggest the implantation of a sentinel surveillance and of population-based studies.

Desempenho da cultura líquida MGIT após implementação em uma rede de laboratórios públicos do estado de São Paulo / Performance of liquid culture MGIT after implementation in a network of public laboratories of Sao Paulo state

A OMS, em 2007, recomendou a implementação da cultura líquida para o diagnóstico da tuberculose (TB) e teste de sensibilidade para países de baixa e média renda. Neste estudo foi avaliado odesempenho da cultura líquida MGIT em condição de rotina após dois anos de implantação em uma rede de laboratórios públicos. Foi efetuada análise retrospectiva de dados da cultura líquida,realizadas em dez laboratórios regionais do Instituto Adolfo Lutz, de janeiro a março de 2010. Foram incluídas amostras submetidas a baciloscopia, cultura líquida MGIT automatizada ou manual eidentificação presuntiva do complexo Mycobacterium tuberculosis (CMTB). Foram detectadas 1.159 culturas positivas. Destas, 113 (9,7%) contaminaram, e 1.046 foram analisadas, sendo 850 (81,3%) CMTB, 116 (11,1%) micobactérias não tuberculosas e 6 (0,6%) Nocardia sp. A taxa de contaminação foi de 2,2% e o acréscimo da cultura para o diagnóstico da TB foi de 29,9%. A média do tempo de detecção da cultura foi de 14,7 dias (DP+/- 11,7 dias). A acurácia da identificação presuntiva foide 91,3%. A cultura líquida MGIT demonstrou ser excelente alternativa para efetuar diagnóstico da TB e das micobacterioses, em razão da rapidez possibilitando uma intervenção rápida e eficaz no tratamento.

In 2007, WHO recommended the implementation of liquid culture for tuberculosis (TB) diagnosis anddrug-susceptibility test in low and middle-income countries. This study evaluated the performanceof MGIT culture in routine condition after two years of its implementation in a public laboratoriesnetwork. This is a retrospective study, which analyzed the data on the liquid culture performed in ten regional laboratories of the Institute Adolfo Lutz, from January to March 2010. The data included clinical samples submitted to microscopy, automated or manual MGIT culture and presumptive M. tuberculosis complex (MTBC) identification by analyzing the cord formation. Culture waspositive in 1,159 samples. Of these, 113 (9.7%) contaminated, and 1,046 were analyzed, of which 850 (81.3%) were identified as MTBC, 116 (11.1%) as non-tuberculous mycobacteria and 6 (0.6%)as Nocardia sp. Contamination rate was 2.2% and the contribution of culture to the TB diagnosis was 29.9%. The detection mean time was 14.7 days (SD+/-11.7 days). The accuracy of the presumptive identification of MTBC was 91.3%. MGIT liquid culture demonstrated to be an excellent alternative for diagnosing TB and mycobacterioses, because of the rapidity of diagnosis, thus allowing an immediate and effective treatment.

Desempenho da cultura líquida MGIT após implementação em uma rede de laboratórios públicos do estado de São Paulo / Performance of liquid culture MGIT after implementation in a network of public laboratories of Sao Paulo state

A OMS, em 2007, recomendou a implementação da cultura líquida para o diagnóstico da tuberculose (TB) e teste de sensibilidade para países de baixa e média renda. Neste estudo foi avaliado o desempenho da cultura líquida MGIT em condição de rotina após dois anosde implantação em uma rede de laboratórios públicos. Foi efetuada análise retrospectiva de dados da cultura líquida, realizadas em dez laboratórios regionais do Instituto Adolfo Lutz, de janeiro a março de 2010. Foram incluídas amostras submetidas a baciloscopia, cultura líquida MGIT automatizada ou manual e identificação presuntiva do complexo Mycobacterium tuberculosis (CMTB). Foram detectadas 1.159 culturas positivas. Destas, 113 (9,7%) contaminaram, e 1.046 foram analisadas, sendo 850 (81,3%) CMTB, 116 (11,1%) micobactérias não tuberculosas e 6 (0,6%) Nocardia sp A taxa de contaminação foi de 2,2% e o acréscimo da cultura para o diagnóstico da TB foi de 29,9%. A média do tempo de detecção da cultura foi de 14,7 dias (DP+/- 11,7 dias). A acurácia da identificação presuntiva foi de 91,3%. A cultura líquida MGIT demonstrou ser excelente alternativa para efetuar diagnóstico da TB e das micobacterioses, em razão da rapidez possibilitando uma intervenção rápida e eficaz no tratamento.

In 2007, WHO recommended the implementation of liquid culture for tuberculosis (TB) diagnosis and drug-susceptibility test in low and middle-income countries. This study evaluated the performance of MGIT culture in routine condition after two years of its implementation in a public laboratories network.This is a retrospective study, which analyzed the data on the liquid culture performed in ten regional laboratories of the Institute Adolfo Lutz, from January to March 2010. The data included clinical samples submitted to microscopy, automated or manual MGIT culture and presumptive M. tuberculosis complex (MTBC) identification by analyzing the cord formation. Culture was positive in 1,159 samples. Of these, 113 (9.7%) contaminated, and 1,046 were analyzed, of which 850 (81.3%) were identified as MTBC, 116 (11.1%) as non-tuberculous mycobacteria and 6 (0.6%) as Nocardia sp. Contamination rate was 2.2% and the contribution of culture to the TB diagnosis was 29.9%. The detection mean time was 14.7 days (SD+/-11.7 days). The accuracy of the presumptive identification of MTBC was 91.3%. MGIT liquid culture demonstrated to be an excellent alternative for diagnosing TB and mycobacterioses, because of the rapidity of diagnosis, thus allowing an immediate and effective treatment.

Tuberculose multirresistente e extensivamente resistente em área metropolitana de elevada incidência - município de Santos (SP), Brasil / Multidrug and extensively drug-resistant tuberculosis in the metropolitan area of high incidence - the city of Santos (SP), Brazil

INTRODUÇÃO: A incidência de tuberculose (TB) em Santos (SP) situa-se em 73/100.000 habitantes-ano. A prevalência média de coinfecção TB/HIV é de 16%, taxas de cura e abandono de tratamento, entre casos novos são, respectivamente, 71% e 12%. Tais indicadores sugerem elevado risco para TB multidroga resistente (TBMR) no município, com incidência estimada em 1,9/100.000 habitantes-ano. OBJETIVO: Descrever e analisar o perfil de sensibilidade às drogas (TS) de primeira e segunda linha de tratamento entre pacientes com TB pulmonar (TBP), estimar a incidência de TBMR e a proporção de TB extensivamente resistente (TBXR); analisar aspectos moleculares, epidemiológicos e institucionais dos casos de TBP resistentes em Santos (SP). MÉTODOS: Estudo descritivo de uma coorte de pacientes de TBP, com início de tratamento ou retratamento entre 01 de janeiro de 2011 a 31 de dezembro de 2012. Definiu-se como caso de TBP, indivíduos com 15 anos ou mais, de ambos os sexos, residentes no município de Santos, com manifestações clínicas compatíveis com TBP e confirmação por cultura com isolamento de Mycobacterium tuberculosis. As variáveis de interesse para o estudo foram as características sociodemográficas, história atual e pregressa de TB, aspectos relativos ao tratamento, co-morbidades, ao diagnóstico e resistência a drogas. Para as análises comparativas entre proporções foram usados os testes qui-quadrado de Pearson e o Exato de Fisher e para variáveis contínuas o teste T de Student ou o de Kruskal - Wallis. Os perfis genéticos dos isoladas resistentes a ao menos uma droga foram obtidos pela técnica RLFP e analisados pelo programa Bionumerics versão 5.0 (Applied Maths - Bélgica). A descrição da distribuição espacial da TB resistentes e clusters foram feitas mediante a inserção dos casos no mapa de Santos, por endereço de residência, segundo o índice de vulnerabilidade social. RESULTADOS: Dos 263 casos de TBP selecionados, 68,4% (180/263) eram do sexo masculino, a mediana da...

INTRODUCTION: The incidence of tuberculosis (TB) in Santos (SP) is located around 73 / 100,000-year, approximately double that found on average in the country. The average prevalence of TB / HIV is 16% cure rates and treatment dropout among new cases are, respectively, 71% and 12%. Such indicators suggest high risk for multidrug-resistant TB (MR-TB) in the city, with the incidence estimated at 1.9 / 100,000-year. OBJECTIVE: To describe and analyze the sensitivity to drugs of first and second line treatment of patients with pulmonary TB (PTB) to estimate the incidence of MR-TB and extensively drugresistant TB (TBXR), describe molecular and institutional aspects, spatial distribution, epidemiological PTB resistant cases in the city of Santos (SP). METHODS: A descriptive study of a cohort of patients with PTB residing in the city who started treatment or retreatment in the period January 2011 to December 31, 2012. The case definition PTB individuals 15 years or more, both sexes, living in the city of Santos (SP), who present clinical manifestations compatible with PTB and whose confirmation was made by culture with isolation of M. tuberculosis. The variables of interest for the study were: bacteriological / laboratory socio-demographic characteristics, current and previous history of TB, aspects related to treatment, and comorbidities. For comparative analyzes of proportions the chi-squared tests and Fisher's exact were used for continuous variables and the Student t test or the Kruskal - Wallis. The genetic profiles of isolates resistant to at least one drug were obtained by RFLP (length polymorphism restriction fragment) and analyzed using version BioNumerics 5.0 (Applied Maths - Belgium) software. The description of the spatial distribution of resistant TB and the clusters was made by inserting the cases in Santos map, by address of residence, which was according to the index of social vulnerability. RESULTS: Of the 263 cases of PTB selected, 68.4% (180/263)...

A study of multidrug-resistant tuberculosis in risk groups in the city of Santos, São Paulo, Brazil

Monitoring the extent of and trends in multidrug-resistant tuberculosis (MDR-TB) is a priority of the Brazilian National Tuberculosis Control Programme. The current study aimed to estimate the incidence of MDR-TB, describe the profile of TB drug resistance in risk groups and examine whether screening for MDR-TB adhered to the recommended guidelines. A descriptive study that examined diagnosed cases of pulmonary TB was conducted in the city of Santos, Brazil, between 2000-2004. Of the 2,176 pulmonary TB cases studied, 671 (30.8%) met the criteria for drug sensitivity testing and, of these cases, 31.7% (213/671) were tested. Among the tested cases, 9.4% were resistant to one anti-TB drug and 15% were MDR. MDR was observed in 11.6% of 86 new TB cases and 17.3% of 127 previously treated cases. The average annual incidence of MDR-TB was 1.9 per 100,000 inhabitants-years. The extent of known MDR-TB in the city of Santos is high, though likely to be underestimated. Our study therefore indicates an inadequate adherence to the guidelines for MDR-TB screening and suggests the necessity of alternative strategies of MDR-TB surveillance.

Baciloscopia para tuberculose pulmonar: estudo multicêntrico do esfregaço para baciloscopia de escarro no diagnóstico da tuberculose pulmonar segundo a Organização Mundial da Saúde e o Ministério da Saúde / Bacilloscopy for pulmonary tuberculosis: multicenter study of bacilloscopy sputum smears in the diagnosis of pulmonary tuberculosis according to the World Health Organization and Brazilian Ministry of Health

A baciloscopia de escarro no diagnóstico da tuberculose pulmonar foi padronizada pela OMS quanto à preparação, coloração e leitura do esfregaço. O Ministério da Saúde (MS) adota esta padronização na coloração e leitura, mas o esfregaço é realizado na forma estendida em 2/3 da lâmina, diferentemente do formato elíptico da OMS. O objetivo deste trabalho foi comparar os dois tipos de esfregaços, avaliando sensibilidade/especificidade, tempo gasto na preparação e leitura e questões de biossegurança. Participaram do estudo oito laboratórios regionais do Instituto Adolfo Lutz. Durante três meses, foram preparadas duas lâminas com 356 amostras de escarro, uma segundo a OMS e outra de acordo com o MS. A leitura foi realizada pela contagem semi quantitativa em cruzes, conforme o índice baciloscópico recomendado pelo MS/OMS. A sensibilidade no esfregaço elíptico foi de 97,0por cento, especificidade 97,5por cento, acurácia 97,2por cento e erro 2,8por cento. A concordância dos resultados de leitura em cruzes foi de: 80,7por cento nos raros BAAR; 83,7por cento nos 1positivo; 89,8por cento nos 2positivo;90,9por cento nos 3positivo e 97,5por cento nos negativos (Kappa igual 0,87 valor p menor que 0,001). A confecção (valor p igual 0,03) e a leitura do esfregaço (valor p igual 0,01) mostraram-se mais rápidas pelo método da OMS e também mais apropriadas em relação à biossegurança. Este estudo demonstrou a viabilidade de se adotar no Brasil o esfregaço padronizado mundialmente pela OMS.

Características da tuberculose pulmonar em área hiperendêmica: município de Santos (SP) / Characteristics of pulmonary tuberculosis in a hyperendemic area: the city of Santos, Brasil

OBJETIVO: Caracterizar o perfil dos pacientes com tuberculose pulmonar (TBP) no município de Santos (SP) segundo fatores biológicos, ambientais e institucionais. MÉTODOS: Estudo descritivo, com dados obtidos na vigilância da TB, abrangendo pacientes com TBP maiores de 15 anos de idade, residentes em Santos (SP) e com tratamento iniciado entre 2000 e 2004. RESULTADOS: Foram identificados 2.176 casos, e 481 apresentavam história prévia de TB. Desses, 29,3 por cento curaram-se no episódio anterior, e 70,7 por cento abandonaram o tratamento. Em 61,6 por cento e em 33,8 por cento dos casos, o diagnóstico foi confirmado por baciloscopia e por critérios clínico-radiológicos, respectivamente; 69.0 por cento eram homens, e 69,5 por cento situavam-se entre 20 a 49 anos. Houve 732 hospitalizações, com tempo médio de permanência de 32 dias na primeira internação. A prevalência de alcoolismo, diabetes e coinfecção TB/HIV foi de, respectivamente, 11,7 por cento, 8,2 por cento e 16,2 por cento, com declínio dessa última de 20,7 por cento para 12,9 por cento no período de estudo. O desfecho do tratamento para 71,0 por cento, 12,1 por cento, 3,2 por cento e 3,3 por cento foi, respectivamente, cura, abandono, óbito por TB e óbito por TB/HIV. O tratamento supervisionado de curta duração foi aplicado em 63,4 por cento dos casos, e não houve diferenças nos desfechos entre os tipos de tratamento (p > 0,05). A incidência anual média de TBP foi de 127,9/100.000habitantes (variação: 72,8-272,92/100.000 conforme a região). A taxa anual média de mortalidade por TBP foi de 6,9/100.000 habitantes. CONCLUSÕES: Em áreas hiperendêmicas de TB, o tratamento supervisionado de curta duração deve ser priorizado para os grupos de risco para o abandono de tratamento ou óbito, e a busca de TB entre contatos deve ser intensificada.

OBJECTIVE: To characterize the profile of patients with pulmonary tuberculosis (PTB) in the city of Santos, Brazil, according to biological, environmental and institutional factors. METHODS: Descriptive study, using the TB surveillance database, including patients with PTB, aged 15 years or older, residing in the city of Santos and whose treatment was initiated between 2000 and 2004. RESULTS: We identified 2,176 cases, of which 481 presented a history of TB. Of those 481 patients, 29.3 percent were cured, and 70.7 percent abandoned treatment. In 61.6 percent of the cases, the diagnosis was confirmed by sputum smear microscopy, whereas it was confirmed based on clinical and radiological criteria in 33.8 percent; 69.0 percent were male; and 69.5 percent were between 20 and 49 years of age. There were 732 hospitalizations, and the mean length of hospital stay was 32 days (first hospitalization). The prevalence of alcoholism, diabetes and TB/HIV coinfection was, respectively, 11.7 percent, 8.2 percent and 16.2 percent. The prevalence of TB/HIV coinfection decreased from 20.7 percent to 12.9 percent during the study period. The treatment outcome was cure, abandonment, death from TB and death attributed to TB/HIV coinfection in 71.0 percent, 12.1 percent, 3.9 percent and 2.5 percent, respectively. The directly observed treatment, short-course (DOTS) was adopted in 63.4 percent of cases, and there were no significant differences between DOTS and the conventional treatment approach in terms of outcomes (p > 0.05). The mean annual incidence of PTB was 127.9/100,000 population (range: 72.8-272.92/100,000 population, varying by region). The mean annual mortality rate for PTB was 6.9/100,000 population. CONCLUSIONS: In areas hyperendemic for TB, DOTS should be prioritized for groups at greater risk of treatment abandonment or death, and the investigation of TB contacts should be intensified.

Identificação laboratorial de micobactérias em amostras respiratórias de pacientes HIV-positivos com suspeita de tuberculose / Laboratory identification of mycobacteria in respiratory samples from HIV-positive patients suspected of tuberculosis

Foram analisados retrospectivamente os registros (2000 a 2004) do Laboratório de Microbiologia do Instituto Adolfo Lutz de Santos, SP referentes a pacientes infectados pelo virus da imunodeficiência humana com suspeita de tuberculose pulmonar. Foram encaminhadas 1.321 amostras com finalidade de diagnóstico, correspondendo a 880 casos suspeitos de tuberculose em 693 pacientes. Cento e trinta e quatro baciloscopias foram positivas e em 188 culturas houve crescimento de micobactérias, correspondendo a 161 casos confirmados. Houve identificação de Mycobacterium tuberculosis em 126 (78,3 por cento) e micobactérias não tuberculosas em 39 (24,2 por cento). Em quatro casos, houve concomitância de Mycobacterium tuberculosis e micobactérias não tuberculosas (porém em amostras distintas). O perfil de sensibilidade às drogas antituberculose revelou 18 (14,3 por cento) casos de resistência a pelo menos um medicamento. Estes resultados reforçam a necessidade de submeter à rotina laboratorial completa - baciloscopia, cultura com identificação e testes de sensibilidade às drogas - as amostras respiratórias de pacientes soropositivos para o vírus da imunodeficiência humana com suspeita de tuberculose para direcionamento terapêutico adequado.

The records (2000 to 2004) of the Microbiology Laboratory of the Adolfo Lutz Institute in Santos, Brazil, were retrospectively analyzed regarding patients infected with the human immunodeficiency virus (HIV) and suspected of pulmonary tuberculosis. 1,321 samples for diagnosis purposes were selected, corresponding to 880 suspected tuberculosis cases in 693 patients. There were 134 smear-positive samples and mycobacteria growth occurred in 188 cultures, corresponding to 161 confirmed cases. Mycobacterium tuberculosis was identified in 126 (78.3 percent) and non-tuberculous mycobacteria in 39 (24.2 percent). In four cases, both Mycobacterium tuberculosis and non-tuberculous mycobacteria were simultaneously recovered from different samples. The profile of sensitivity to anti-tuberculosis drugs revealed 18 (14.3 percent) cases of resistance to at least one drug. These results reinforce the need to carrying out the complete laboratorial routine (sputum smear microscopy, culture and susceptibility to antituberculous drugs) for respiratory samples from human immunodeficiency virus-positive patients with suspected tuberculosis in order to direct appropriate therapy.

Estudo comparativo entre um sistema de sonda genética e métodos clássicos na identificação das micobactérias / Gene probes versus classical methods in the identification of mycobacteria

OBJETIVO: O aparecimento da co-infecção tuberculose/HIV e o aumento de casos de doenças provocadas por micobactérias não-tuberculosas (MNT) exigem repostas laboratoriais rápidas tanto no isolamento como na identificação das micobactérias. O objetivo deste trabalho foi avaliar a identificação das micobactérias através de sonda genética em comparação com os métodos bioquímicos clássicos. MÉTODOS: Entre 2002 e 2004, foram analisadas 178 culturas de micobactérias, confirmadas como bacilos álcool-ácido resistentes e obtidas de isolados clínicos de pacientes sintomáticos respiratórios ou com suspeita clínica de tuberculose pulmonar e/ou micobacterioses, atendidos nas Unidades de Saúde da Baixada Santista. RESULTADOS: A sonda genética identificou 137 amostras (77%) como complexo Mycobacterium tuberculosis e 41 (23%) como MNT. A discordância observada de 3% entre os métodos ocorreu apenas no ano de implantação (2002). Ao comparar os métodos, a sensibilidade, especificidade, valor preditivo positivo e valor preditivo negativo da sonda genética foram 98%, 93%, 98% e 93%, respectivamente. CONCLUSÕES: Apesar do custo elevado, a identificação de micobactérias pela técnica molecular é mais rápida: máximo de 3 h vs. 28-30 dias para os métodos clássicos. A utilização de sondas genéticas é uma técnica molecular validada, simples e disponível no mercado, com elevada especificidade, sensibilidade e rapidez, o que justifica sua implantação e uso rotineiro em laboratórios de referência, facilitando o diagnóstico e permitindo uma intervenção clínica ágil.

OBJECTIVE: The emergence of tuberculosis/HIV co-infection and the increase in the number of cases of infection with nontuberculous mycobacteria (NTM) require rapid laboratory test results in the isolation and identification of mycobacteria. The objective of this study was to evaluate the identification of mycobacteria by means of gene probes in comparison with that obtained using classical biochemical methods. METHODS: Between 2002 and 2004, 178 mycobacterial cultures, all testing positive for acid-fast bacilli, were analyzed. Samples were obtained from clinical specimens of patients with respiratory symptoms or with clinical suspicion of pulmonary tuberculosis/mycobacteriosis who were treated in the greater metropolitan area of Santos. RESULTS: The gene probe identified 137 samples (77%) as Mycobacterium tuberculosis complex and 41 (23%) as NTM. Discordant results between the methods (3%) were obtained only in the year of implementation (2002). When comparing the methods, the sensitivity, specificity, positive predictive value and negative predictive value of the gene probe method were 98%, 93%, 98% and 93%, respectively. CONCLUSIONS: Despite the cost, the identification of mycobacteria using the molecular technique is faster: maximum 3 h vs. 28-30 days for classical methods. The use of gene probes is a validated molecular technique. It is fast, easy to use and readily available on the market. It has high specificity and sensitivity, which justifies its implementation and routine use in referral laboratories, since it facilitates the diagnosis providing agile clinical interventions.

Estudo descritivo da freqüência de micobactérias não tuberculosas na Baixada Santista (SP) / Descriptive study of the frequency of nontuberculous mycobacteria in the Baixada Santista region of the state of São Paulo, Brazil

OBJETIVO: Este estudo teve por objetivo descrever a freqüência das espécies de micobactérias não tuberculosas (MNT) identificadas laboratorialmente a partir do isolamento de sítios não estéreis (escarro) de indivíduos infectados ou não pelo vírus HIV na Baixada Santista (SP), período de 2000 a 2005. MÉTODOS: Foi realizada análise retrospectiva dos resultados de baciloscopia e cultura, disponíveis nos registros do laboratório regional de tuberculose, Instituto Adolfo Lutz-Santos. RESULTADOS: Analisou-se 194 cepas de MNT correspondentes a 125 indivíduos, sendo 73 (58,4 por cento) HIV negativos e 52 (41,6 por cento) HIV positivos. Foram identificadas 13 diferentes espécies: Mycobacterium kansasii; complexo M. avium; M. fortuitum; M. peregrinum; M. gordonae; M. terrae; M. nonchromogenicum; M. intracellulare; M. flavescens; M. bohemicum; M. chelonae; M. shimoidei; e M. lentiflavum. Em 19,2 por cento dos casos obteve-se diagnóstico bacteriológico confirmado pelo isolamento da mesma espécie em no mínimo duas amostras consecutivas. CONCLUSÕES: Os resultados mostram a importância da realização sistemática da identificação de MNT na rotina laboratorial e sua integração com a clínica, podendo contribuir na caracterização da doença e ações de efetivo controle, como nas populações co-infectadas tuberculose e HIV.

OBJECTIVE: The present study aims at describing the frequency of nontuberculous mycobacteria (NTM) species identified through laboratory testing of samples collected from non-sterile sites (sputum), as well as its frequency in HIV-infected and non-HIV-infected individuals in the Baixada Santista region of the state of São Paulo, Brazil, in the period from 2000 to 2005. METHODS: Retrospective analysis of sputum smear microscopy results and culture was conducted based on the records on file at the Instituto Adolfo Lutz-Santos, the regional tuberculosis laboratory. RESULTS: We analyzed 194 NTM strains isolated from 125 individuals, of whom 73 (58.4 percent) were HIV-negative and 52 (41.6 percent) were HIV-positive. Thirteen different species were identified: Mycobacterium kansasii; M. avium complex; M. fortuitum; M. peregrinum; M. gordonae; M. terrae; M. nonchromogenicum; M. intracellulare; M. flavescens; M. bohemicum; M. chelonae; M. shimoidei; and M. lentiflavum. In 19.2 percent of the cases, the bacteriological diagnosis was confirmed by isolation of the same species in at least two consecutive samples. CONCLUSIONS: Our results show the importance of including systematic identification of NTM in the laboratory routine, and that its integration into the clinical routine could improve the characterization of the disease, thereby informing the planning of effective control measures in specific populations, such as individuals presenting tuberculosis/HIV co-infection.

Avaliação do crescimento em cordas na identificação presuntiva do complexo Mycobacterium tuberculosis / Detection of cord factor for the presumptive identification of Mycobacterium tuberculosis complex

OBJETIVO: O Mycobacterium tuberculosis, sob certas condições apropriadas, cresce em cordões de serpentinas, denominados de fator corda, ou crescimento em cordas. O objetivo deste estudo é avaliar a detecção do fator corda como método de identificação presuntiva do complexo M. tuberculosis, comparando-o aos testes de tipificação (TIP) convencionais. MÉTODO: Foram analisadas 743 cepas, de janeiro de 2002 a dezembro de 2005, na Área de Micobactérias do Instituto Adolfo Lutz - Santos, obtidas de isolados clínicos coletados de pacientes sintomáticos respiratórios ou com suspeita clínica de tuberculose pulmonar e/ou micobacterioses, atendidos nas Unidades Básicas de Saúde da Baixada Santista. Foram feitos esfregaços das cepas de micobactérias isoladas em meio líquido MB/BacT e meio sólido, Lowenstein-Jensen ou Ogawa-Kudoh, sendo 301 (40,5 por cento) cepas em meio líquido e 442 (59,5 por cento) em meio sólido. RESULTADOS: Os resultados de sensibilidade, especificidade e valores preditivos positivos e negativos, obtidos com a comparação do desempenho do método em ambos os meios de isolamento e TIP convencionais, foram respectivamente 98,5, 88, 97 e 93 por cento. Observou-se maior sensibilidade do método em meio sólido (100 por cento), com uma diferença de sensibilidade entre os meios analisados de apenas 2,7 por cento. CONCLUSÕES: Conclui-se, pelos resultados obtidos, que o fator corda é um critério real e rápido na identificação do complexo M. tuberculosis; além disso, em laboratórios com alta prevalência do complexo M. tuberculosis e que não dispõem de técnicas que permitam a precocidade de sua identificação, o fator corda possibilita o direcionamento aos testes conclusivos de identificação e adicionais de sensibilidade que se façam necessários.

OBJECTIVE: Virulent strains of the Mycobacterium tuberculosis complex, under certain appropriate conditions, grow as characteristic ropes, bundles or serpentine cords known as cord factor or growth in cords. The objective of the present study was to evaluate cord factor detection as a method of achieving presumptive identification of the M. tuberculosis complex, comparing it to conventional typing tests. METHODS: A total of 743 strains were analyzed from January of 2002 to December of 2005 in the Mycobacteria Sector of the Adolfo Lutz Institute, located in the city of Santos, Brazil. Samples were obtained from clinical specimens collected from patients with respiratory symptoms treated at basic health clinics in the greater metropolitan area of Santos. Ziehl-Neelsen-stained smears were prepared, 301 (40.5 percent) in MB/BacT broth and 442 (59.5 percent) on solid media, either Lowenstein-Jensen or Ogawa-Kudoh. RESULTS: The sensitivity, specificity, positive predictive value and negative predictive value obtained during the performance comparison of the two methods (cord factor detection and conventional typing) using both isolation media were, respectively, 98.5, 88, 97 and 93 percent. The method was more sensitive on solid medium (100 percent), and the difference in sensitivity between the two media types was only 2.7 percent. CONCLUSIONS: Taking into consideration the results obtained, we conclude that, in laboratories with a high incidence of M. tuberculosis complex isolation and limited economic resources, cord factor detection is a fast and valid criterion for identifying these mycobacteria using liquid or solid medium. It also enables subsequent conclusive identification tests, as well as additional sensitivity tests when necessary.

Perfil da tuberculose multidroga resistente no município de Santos, 2000-2004 / Factors associated to the tuberculosis caused by tuberbulosis multidrug resistant Santos municipality 2000-2004

Descrever as características dos pacientes com tuberculose pulmonar (TBP), estimar a magnitude e o perfil de resistência do M. tuberculosis às drogas antituberculose droga resistência (MDR), no município de Santos - SP, entre 2000 e 2004 e discutir critérios de triagem de pacientes com TB, para a indicação de teste de sensibilidade. Método: Estudo de coorte retrospectivo. A população de estudo é formada por pacientes com TBP, residentes em Santos, maiores de 15 anos. As fontes de dados são: vigilância regional da TB e o Instituto Adolfo Lutz Central e Regional de Santos. Descreveram-se os caracteres epidemiológicos relativos ao tempo, espaço e pessoa, segundo as variáveis sóciodemográficas, história atual e pregressa de TB, co-morbidades e condições, aspectos relativos ao diagnóstico e ao tratamento, assim como o perfil de resistência às drogas utilizadas no tratamento. A associação entre TBMDR e as variáveis de interesse foi investigada pelas estimativas não ajustadas e ajustadas da odds ratio, com os respectivos intervalos de confiança de 95%, usando regressão logística não condicional. Resultados: Identificamos 2.176 pacientes, 69,7% eram do sexo masculino, 69,5% situavam-se entre 20 e 49 anos de idade, 71% evoluíram para cura, 12,1% abandonaram o tratamento e 3,9% faleceram. A taxa de incidência anual média de TB pulmonar foi de 127,9/100.000 e de TBMDR pulmonar 1,9/100.000 habitantes. A TBMDR foi observada em 15% dos pacientes. Conclusões: Os fatores de risco apontados como associados à TBMDR, a elevada incidência de TBMDR, bem como a descrição detalhada dos casos de TB pulmonar e de TBMDR podem auxiliar a vigilância municipal na elaboração de estratégias específicas ao controle da TB, visando redução das elevadas taxas de resistência e mortalidade.

Perfil da tuberculose multidroga resistente no município de Santos, 2000-2004

Descrever as características dos pacientes com tuberculose pulmonar (TBP), estimar a magnitude e o perfil de resistência do M. tuberculosis às drogas antituberculose droga resistência (MDR), no município de Santos - SP, entre 2000 e 2004 e discutir critérios de triagem de pacientes com TB, para a indicação de teste de sensibilidade. Método: Estudo de coorte retrospectivo. A população de estudo é formada por pacientes com TBP, residentes em Santos, maiores de 15 anos. As fontes de dados são: vigilância regional da TB e o Instituto Adolfo Lutz Central e Regional de Santos. Descreveram-se os caracteres epidemiológicos relativos ao tempo, espaço e pessoa, segundo as variáveis sóciodemográficas, história atual e pregressa de TB, co-morbidades e condições, aspectos relativos ao diagnóstico e ao tratamento, assim como o perfil de resistência às drogas utilizadas no tratamento. A associação entre TBMDR e as variáveis de interesse foi investigada pelas estimativas não ajustadas e ajustadas da odds ratio, com os respectivos intervalos de confiança de 95%, usando regressão logística não condicional. Resultados: Identificamos 2.176 pacientes, 69,7% eram do sexo masculino, 69,5% situavam-se entre 20 e 49 anos de idade, 71% evoluíram para cura, 12,1% abandonaram o tratamento e 3,9% faleceram. A taxa de incidência anual média de TB pulmonar foi de 127,9/100.000 e de TBMDR pulmonar 1,9/100.000 habitantes. A TBMDR foi observada em 15% dos pacientes. Conclusões: Os fatores de risco apontados como associados à TBMDR, a elevada incidência de TBMDR, bem como a descrição detalhada dos casos de TB pulmonar e de TBMDR podem auxiliar a vigilância municipal na elaboração de estratégias específicas ao controle da TB, visando redução das elevadas taxas de resistência e mortalidade.